Съвременните науки, използвайки логиката като инструмент на познанието, често срещат теоретични противоречия или противоречия между последствията от теорията и вербализираните резултати от опита, експериментират. Това понякога се дължи на логически грешки в конструирането на преценки, несъвършенство на съществуващите понастоящем научни методи или недостатъчна точност на инструментите, използвани в експериментите, както и на неадекватността на приетата идеализация, тоест неправилна аксиоматизация на теориите.
Наличието на парадокс стимулира нови изследвания, по-задълбочено разбиране на теорията, нейните „очевидни“постулати и често води до пълното й преразглеждане.
Парадокси разкриват дълбоките течения на когнитивния процес. Провъзгласявайки за непосредствената неприятност в науката, те в същото време решително я изтласкват напред и точно, като внасят нови, още по-парадоксални идеи.
Примери за парадокси в науката са Парадоксът на Ръсел, Парадоксът на Банах-Тарски, Парадоксът на Гарай, Парадоксът на Смале, Парадоксът на Хаусдорф, Парадоксът на EPR, Космологичните парадокси.
Парадоксите в науката, от една страна, показват криза на старото научно познание (което обяснява негативното отношение на много учени към това явление), от друга страна, те допринасят за развитието на нов, това доказва тяхната полезност и дори определена необходимост. Тук можете да видите избора между мир и развитие. Ако науката, както трябва, предпочита развитието, тогава учените трябва да приемат парадокси за даденост и да се опитват да използват знанията, които дават, въпреки непознаването и противоречието му с установените правила. Именно това разбиране за парадокса се приема като оптимално за развитието на науката в момента.