Бактериофагите, съдържащи ДНК без опашка, не можеха да бъдат открити по стандартни методи - но сега учените смятат, че те доминират в световните океани.
Всяка капка вода, която не е твърде дълбока от морската повърхност, съдържа около 10 милиона вируса. Едва ли е изненадващо, че биолозите непрекъснато откриват нови, въпреки че откриването на изцяло нова група все още е много рядко. Изглежда, че стандартните техники просто не позволяват да бъдат забелязани, въпреки че подобни вируси се оказаха изключително много - може би те са широко разпространени не само в океана и просто се изплъзват на учените.
Мартин Полз от Масачузетския технологичен институт и неговите колеги изследвали проби от вода, взети край северноамериканския бряг на Атлантическия океан. Те потърсиха вируси, съдържащи двуверижна ДНК - такива вируси са изключително разпространени, включително херпес, и бактериофага Т4 (Caudovirales), познат на всички от училище. Инфектиращи култури от морски бактерии Vibrionaceae, учените откриха 200 различни ДНК вируси, от които 18 бяха приписани на новия ред Autolykiviridae. Те пишат за това в статия, публикувана в списание Nature.
Името на групата се отнася до героя от гръцката митология Autolycus, хитър крадец, който е толкова трудно да се хване, колкото тези вируси. „Най-разпространените вируси на Земята са заразени с бактерии вируси, съдържащи двуверижна ДНК“, пишат Полц и неговите съавтори. „Въпреки това, Caudovirales с опашки, които доминират в базите данни и колекциите от култури, не са представителни за тяхното присъствие в околната среда. Всъщност вирусите без опашка доминират над водните проби."
Бактериални клетки, заразени с Autolykiviridae / MIT Phages, Kauffman et al., 2018.
"Без опашки" бактериофаги Autolykiviridae се различават по малкия си размер на генома - само около 10 хиляди бази, 4-5 пъти по-малко, отколкото при "опашки" роднини. Способността им да заразяват и убиват бактериални клетки също беше необичайна. Ако обикновените фаги в експериментите, като правило, засягат един специфичен вид вибриони, те заразяват средно четири и водят до забележимо по-голяма смърт на клетките. "Установено е, че са отговорни за 40 процента от бактериалната смърт, въпреки че те представляват около 10 процента от общия брой вируси в пробата", обяснява един от авторите на работата.
Вибрио бактерии от различни видове са разположени по периметъра на диаграмата; кръговете на вирусите, които ги заразяват, са свързани с тях: сини - "опашки" бактериофаги, оранжеви - "опашки" Autolykiviridae / MIT, Kauffman et al., 2018.
Тези цифри показват голямата роля, която новата група Autolykiviridae играе в регулирането на бактериалните популации и в биосферата като цяло. Учените са уверени, че тяхната техника ще помогне да се намерят вируси, които преди това са избягали от откриването им в почвата и вероятно в човешкото черво. Подобни генетични последователности наистина се намират в геномите на бактериите в човешката микрофлора.
Промоционално видео:
Сергей Василиев