Група учени изпрати до Министерството на образованието и науката, както и до съответния дисертационен съвет, жалба срещу решението на съвместния дисертационен съвет D 999.073.04 за присъждане на Павел Хондзински на научната степен кандидат на богословие (според заключението на съвета), научната степен на кандидат на философските науки (според резюмето на автора). Текстът на жалбата е публикуван в публичното пространство.
Авторите на документа отбелязват, че научната степен, декларирана в резюмето и текста на дисертацията, не съответства на степента, посочена в документите, създадени след защитата: списъкът на членовете на дисертационния съвет, присъствали на заседанието по време на защитата на дисертацията, и заключението на дисертационния съвет. На 1 юни, когато се проведе защитата, нямаше регулаторни документи, които да предполагат възможността за придобиване на степен „кандидат на богословие“, отбелязват авторите.
Освен това се съобщава, че информацията за резултатите от обществената защита не е публикувана в Интернет в рамките на десет дни от датата на заседанието на дисертационния съвет, а времето за създаване на публикуваните документи е посочено невярно. И накрая, по време на работата на дисертационния съвет беше нарушен принципът на публичност: не само лица, желаещи да участват в дискусията, но и журналисти не бяха допуснати до заседанието. Според мнението на жалбоподателите тези факти показват множество нарушения на действащия Регламент за Съвета за защита на дисертацията.
Документът е подписан от Юрий Панчин (Институт за проблеми с предаването на информация на Руската академия на науките), Владимир Алешин (Научно-изследователски институт по физическа и химическа биология на името на А. Н. Белозерски, Московския държавен университет), Александър Кузнецов и Дмитрий Щербаков (Палеонтологичен институт, РАН).
Дисертационният съвет награди Павел Хондзински с докторска степен по теология на 1 юни 2017 г. От 22-те съветници 21 гласуваха „за“(едно гласуване беше невалидно, тъй като бе попълнено неправилно). Темата на дисертационната работа е „Решаване на проблемите на руското богословие от 18 век в синтеза на св. Филарет, московски митрополит“. По-късно решението на съвета е одобрено от Министерството на образованието и науката.