Находката поднови дебата за мястото на гигантските вируси върху еволюционното дърво. Това вируси или живи клетки ли са загубили способността да се размножават независимо?
Австрийските микробиолози откриха вирус, който се отличава от своите роднини по размер и сложност на устройството. "Рекордьорът", открит в отпадъчните води на град Клостернойбург в източна Австрия, има диаметър около 400 нанометра и размер на генома от 1570 хиляди базови двойки (355 гена). Вирусът е наречен Klosneuvirus след мястото на откриването. За находката се съобщава от списание Science.
Вирусът е открит с помощта на арсенал от метагеномични методи. Най-просто казано, геномът на вируса се сглобяваше парче по парче от фрагментите, намерени във взетите проби. Този подход позволява на изследователите да изследват набора от гени на всички микроорганизми, присъстващи в пробната среда, без да се отглеждат в лаборатория. Самите автори на работата оценяват находката като извършен факт и съобщават за вероятното откриване на три сродни вида в близката област.
Откритието възобнови дебата за това дали гигантските вируси, които периодично са били откривани през последното десетилетие и половина, са вируси в строгия смисъл на думата, или имаме бивши живи клетки, които някога са се превръщали в паразити и по дълъг еволюционен път са загубили доста генетична информация заедно с тези адаптации, който кодира „изхвърлен“. В този случай изглежда логично да се разделят в отделен домейн, равен на бактерии, еукариоти и археи.
Размери на някои известни вируси: Вирус на полиомиелит ~ 30 nm. Zika вирус ~ 45 nm. Аденовирус ~ 90 nm. HIV-1 ~ 120 nm. Мимивирус ~ 400 nm
Всъщност повечето вируси са много по-малки от клетките, в които нахлуват, и имат много скромни размери на генетичния материал. Някои видове птичи и свински вируси струват само два гена за възпроизвеждане, срещу хиляди дори обикновена бактерия. Така например, добре познатата Е. coli съдържа 4400 гена - и това все още не е запис. Известните гигантски вируси (първият е открит през 2003 г. и общо са описани около половин дузина от тях) съдържат около една или две хиляди гени всеки, което очевидно надвишава броя, който е минимален, необходим за „улавяне“на клетка и последващото й използване. Някои организми, за които е известно, че са способни на независим живот и размножаване, струват по-малко.
Скептиците не виждат необходимостта от четвъртия домейн, обяснявайки генетичната излишък на гигантски вируси чрез заемане на материал-гостоприемник. Например Евгений Кунин (Национален център за биотехнологична информация, Бетесда, Мериленд) нарича "кристално ясно", че гигантските вируси принадлежат към групи, които включват много по-малки форми. Като цяло самите автори на откритието са склонни към тази гледна точка. Обединявайки се с колегите, те показаха, че гигантските вируси постепенно заемат генетичен материал от различни гостоприемници. „Няма доказателства за четвърти домейн и този документ потвърждава това“, казва Къртис Сътъл, вирусолог от Университета на Британска Колумбия във Ванкувър, Канада.
Освен това скептиците поставят под съмнение самия факт на откритието. Микробиологът Дидие Раулт от университета в Марсилия отбелязва, че преди да се направят изводи за еволюцията от генома, би било хубаво да се види неговият собственик. Последователността на гените сама по себе си е незначителен аргумент: те често сменят местата си и претърпяват други промени, които прикриват произхода им.
Промоционално видео:
Сергей Сисоев