Участниците в консорциума Genome 10K на годишната конференция, която в момента се провежда в Ню Йорк, обявиха старта на международния проект „Геноми на гръбначни животни“, чиято задача е да събере геномите на всички 66 хиляди гръбначни видове, живеещи на планетата днес. Gizmodo разказва повече за целите и задачите на проекта.
През 2009 г. американските биолози Дейвид Хауслер, Оливър Райдър и Стивън О'Брайън основават проекта Genome 10K, чиято цел е да се секвенират 10 000 гръбначни генома. Първоначално в проекта участваха 55 учени от големи зоопаркове, изследователски центрове и музеи. Първоначално не беше ясно колко време ще отнеме геномите с достатъчно качество. Но с цената и опростяването на методите за секвениране стана ясно, че проектът ще изпълни задачите си след няколко години. През последните три години участниците в проекта сравняват основните технологии за секвениране на ДНК и анализ на получените резултати, за да изберат тази, която ще създаде "платинени геноми".
Вчера членовете на Genome 10K обявиха стартирането на нов проект за геном на гръбначни животни, който има за цел да събере мъжки и женски геноми от 66 000 вида гръбначни животни. В проекта ще участват 150 учени, представляващи 50 организации от 12 държави. Според един от основателите на проекта, Оливър Райдър, в резултат биолозите ще могат да разберат причините за изчезването на видовете, включително дали в историята на вида е имало тясно свързани кръстоски, „тесни места“, в резултат на което генетичното разнообразие на даден вид е намаляло или делеции - мутации, които могат да „се изключат“»Гени, необходими за оцеляването на организма.
Заедно с обявяването на новия проект, учените веднага представиха първите резултати от неговата работа: геномите на 15 вида гръбначни животни, включително застрашения папагал сова какапо, ендемичен за Нова Зеландия, и австралийския утконос. Тези и всички други геноми, които изследователите планират да съберат, ще бъдат публикувани в публичното пространство, в базата данни Noah's Ark Genomic.
Участниците планират да секвенират кратки участъци от геномна ДНК и да събират от тях все по-дълги последователности до цялата хромозома и след това да ги „залепват“с помощта на алгоритми, специално разработени за проекта.
Преди това изследователите успяха да прочетат генома на човек на джобен секвенсер с размер на смартфон. Устройството постави рекорда за най-дълго отчитане на ДНК молекула, успя да последователно последователности до 882 хиляди базови двойки.
Екатерина Русакова
